Messori ha lavorato per La Stampa, Il Corriere della sera, Jesus e Avvenire e ha pubblicato una ventina di libri al confine tra la prospettiva laica con cui si è formato e quella cristiana che ha scoperto da adulto. Due delle sue opere le ha scritte con altrettanti Papi: Varcare la soglia della speranza con Giovanni Paolo II e Rapporto sulla fede con lallora cardinale Joseph Ratzinger, futuro BenedettoXVI